1、服务的职能。农村合作社，要为农民服务，使农民能够以低廉的价格购置所需要的生产资料和生活资料，以较高的价格销售出自己的产品。给社员提供技术和信息，给社员提供机会和渠道。并学习发达国家合作社的经验，力争服务的范围越来越广泛，服务的水平越来越上档次。
2、纽带的职能。合作社必须成为政府和农民的纽带，上情下达，下情上达，协助政府贯彻和落实农业与农村政策，把农民的意愿反馈给政府，为政府施政提供第一手材料。合作社也必须成为农民与市场，农民与龙头企业等的纽带，使农民有通畅的销路，商家有稳定的货源，为商家和农民架起一座双赢的金桥。
3、保护的职能。作为弱势群体的代表，合作社必须成为农民利益的代表，为减轻农民的负担，保护农民的权益不受侵害而努力。同时，合作社也要成为农民生活的空间—农村的利益的代表，发挥农民的联合体的作用，保护农村的环境，保护农村的资源，使我国的农业能够可持续的发展。
4、教育的职能。也可以称为培训的职能。合作社作为农民的联合体，必须为社员的素质的提高而努力。农业结构的调整、科技的转化、技术的普及、生产经营与管理水准的提高，都离不开社员素质的提高。目前，在农村劳动力中，小学及其以下文化程度的占总劳动力的40％，文盲和半文盲约占总劳动力的18％。这种现状，不适应今后农业的设施化、机械化、信息化和集约化的要求。
5、示范的职能。据1999年的一项统计：利益关系比较紧密，真正称得上农业产业化组织的只有1万2千个左右，连接农户约2千万户，占全国农村总户数的9％。在21世纪，中国的农村合作社，必须通过自身的发展，带动更多的合作社的成立，带动更多的农民的参加；并在实践中发展一批成功的、具有示范作用的样板社，带动更多的成功社的出现。
6、发展的职能。要总结过去的经验教训，学习发达国家合作……